inst/script/generate_clusters_table.R

In ilyessr/conclus: ScRNA-seq Workflow CONCLUS - From CONsensus CLUSters To A Meaningful CONCLUSion

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#######################  extdata/clusters_table.tsv  ###########################
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## This table gives which cells has been assigned which cluster.
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## This is the code to generate this table:

library("conclus")
load(system.file("extdata/scrFull.Rdat", package="conclus"))

clustCellsDf <- retrieveTableClustersCells(scr)

write.table(clustCellsDf, file="inst/extdata/clusters_table.tsv", sep="\t", 
            quote=FALSE)