R/mappingTable_metabolites.R
In michaelwitting/wormLipidPredictR: Lipid reaction prediction based on WormJam
Defines functions
mappingTable
Documented in
mappingTable
#' @name mappingTable
#'
#' @title Create a mapping table to map between LipidNetworkPredictR and RHEA metabolite names
#'
#' @description
#' The function returns a \code{data.frame} containing information of
#' corresponding features from \code{LipidNetworkPredictR}, the
#' \code{RHEA} database and \code{ChEBI} database.
#'
#' @details
#' The mapping table is derived from the file
#' `rhea-reactions.txt`.
#'
#' @return data.frame
#'
#' @author Thomas Naake, \email{thomasnaake@@googlemail.com}
#'
#' @examples
#' LipidNetworkPredictR:::mappingTable()
mappingTable <- function() {
## name_LipidNetworkPredictR, name_RHEA, ChEBI_ID, RHEA_ID_undetermined, RHEA_ID_left_to_right, RHEA_ID_right_to_left, RHEA_ID_both_directions
res <- rbind(
## dg_to_pa
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_ADP", "ADP", "CHEBI:456216", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
## pc_to_dg
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
## dg_to_tg
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
c("M_TG", "a triacyl-sn-glycerol", "CHEBI:64615", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
## cdpdg_to_pi
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_myo-Inositol", "myo-inositol", "CHEBI:17268", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
## cer_to_glccer
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_UDP-Glucose", "UDP-alpha-D-glucose", "CHEBI:58885", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_GlcCer", "a beta-D-glucosyl-(1<->1')-N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:22801", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_UDP", "UDP", "CHEBI:58223", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
## cdpdg_to_pgp
c("M_Glycerol-3-P", "sn-glycerol 3-phosphate", "CHEBI:57597", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_PGP", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycero-3'-phosphate)", "CHEBI:60110", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
## sn1lpc_to_pc
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
## pc_to_pa
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_Choline", "choline", "CHEBI:15354", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
## sn1lpc_to_fa
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_Glycerophosphocholine", "sn-glycerol 3-phosphocholine", "CHEBI:16870", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
## coa_to_lpa
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
c("M_Glycerol-3-P", "sn-glycerol 3-phosphate", "CHEBI:57597", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
c("M_LPA", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:57970", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
## fa_to_coa
c("M_FA", "a long-chain fatty acid", "CHEBI:57560", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_AcylCoA", "a long-chain fatty acyl-CoA", "CHEBI:83139", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_AMP", "AMP", "CHEBI:456215", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_PPi", "diphosphate", "CHEBI:33019", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_AcylCoA", "a fatty acyl-CoA", "CHEBI:77636", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_AMP", "AMP", "CHEBI:456215", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_PPi", "diphosphate", "CHEBI:33019", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
## pc_to_sn1lpc
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
## pa_to_cdpdg
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_CTP", "CTP", "CHEBI:37563", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_PPi", "diphosphate", "CHEBI:33019", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
## lpep_to_pep
c("M_LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
## lpep_to_fal
c("M_1-LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
c("M_FAL", "a 2,3-saturated aldehyde", "CHEBI:73359", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
c("M_Glycerophosphoethanolamine", "sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:143890", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
## nae_to_fa
## Both are correct, but the second reaction is the more generic one
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_NAE", "N-(long-chain fatty acyl)ethanolamine", "CHEBI:15897", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_FA", "a long-chain fatty acid", "CHEBI:57560", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
c("M_NAE", "an N-acylethanolamine", "CHEBI:52640", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
## coa_to_acdhap
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
c("M_Dihydroxyacetone-P", "dihydroxyacetone phosphate", "CHEBI:57642", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
c("M_AcylDHAP", "a 1-acylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:57534", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
## coa_to_ce
c("M_Cholesterol", "cholesterol", "CHEBI:16113", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
c("M_CE", "a cholesterol ester", "CHEBI:17002", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
## cer_to_cerp
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_ADP", "ADP", "CHEBI:456216", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_CerP", "an N-acylsphing-4-enine 1-phosphate", "CHEBI:57674", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
## pi_to_sn1lpi
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_1-LPI", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:64771", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
## pc_to_sn2lpc
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
## cer_to_sm
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
c("M_SM", "a sphingomyelin", "CHEBI:17636", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
## lpa_to_pa
c("M_LPA", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:57970", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
## ps_to_pe
c("M_PS", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine", "CHEBI:57262", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
c("M_CO2", "CO2", "CHEBI:16526", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
## peo_to_pep
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_Fe2+-cytochrome_b5", "Fe(II)-[cytochrome b5]", "CHEBI:29033", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_O2", "O2", "CHEBI:15379", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_Fe3+-cytochrome_b5", "Fe(III)-[cytochrome b5]", "CHEBI:29034", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
## lpco_to_pco
c("M_1-LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
c("M_PC-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:36702", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
## pa_to_dg
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
## pe_to_ps
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
c("M_L-Serine", "L-serine", "CHEBI:33384", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
c("M_PS", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine", "CHEBI:57262", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
## sn2mg_to_fa
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_FA", "a carboxylate", "CHEBI:29067", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_Glycerol", "glycerol", "CHEBI:17754", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
## pg_to_cl
c("M_PG", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_CL", "a cardiolipin", "CHEBI:62237", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
## cl_to_lcl
c("M_CL", "a cardiolipin", "CHEBI:62237", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_1,2,4-LCL", "1'-[1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho],3'-[1-acyl-sn-glycero-3-phospho]-glycerol", "CHEBI:64743", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
## dg_to_pc
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_CDP-Choline", "CDP-choline", "CHEBI:58779", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
## dg_to_pe
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_CDP-Ethanolamine", "CDP-ethanolamine", "CHEBI:57876", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
## sn2mg_to_dg
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
## sn1lpe_to_fa
c("M_1-LPE", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64381", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_Glycerophosphoethanolamine", "sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:143890", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
## sn1lpe_to_pe
c("M_1-LPE", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64381", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
## nape_to_nae
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_NAE", "an N-acylethanolamine", "CHEBI:52640", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
## sn1lpi_to_pi
c("M_1-LPI", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:64771", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
## sn1lpg_to_pg
c("M_1-LPG", "1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64840", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
c("M_PG", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
## tg_to_dg
c("M_TG", "a triacyl-sn-glycerol", "CHEBI:64615", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_TG", "a triacyl-sn-glycerol", "CHEBI:64615", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
## dg_to_sn2mg
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
## cerp_to_cer
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
c("M_CerP", "an N-acylsphing-4-enine 1-phosphate", "CHEBI:57674", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
## sn1mg_to_lpa
c("M_1-MG", "a 1-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:64683", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_LPA", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:57970", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_ADP", "ADP", "CHEBI:456216", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
## pgp_to_pg
c("M_PGP", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycero-3'-phosphate)", "CHEBI:60110", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
c("M_PG", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
## sn1mg_to_fa
c("M_1-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_Glycerol", "glycerol", "CHEBI:17754", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
## dg_to_sn1mg
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_1-MG", "a 1-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:64683", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_1-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
## lcl_to_cl
c("M_1,2,4-LCL", "1'-[1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho],3'-[1-acyl-sn-glycero-3-phospho]-glycerol", "CHEBI:64743", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
c("M_CL", "a cardiolipin", "CHEBI:62237", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
## lpco_to_mgo
c("M_1-LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_1-MG-O", "1-O-alkyl-sn-glycerol", "CHEBI:15850", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
## acyldhap_to_alkyldhap
c("M_AcylDHAP", "a 1-acylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:57534", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_FAO", "a long chain fatty alcohol", "CHEBI:17135", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_FA", "a long-chain fatty acid", "CHEBI:57560", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_AlkylDHAP", "1-O-alkylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:73315", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
## alkyldhap_to_lpao
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_NADPH", "NADPH", "CHEBI:57783", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_AlkylDHAP", "1-O-alkylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:73315", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_LPA-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58014", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_NADP", "NADP(+)", "CHEBI:58349", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
## dgo_to_pco
c("M_DG-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:52595", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_CDP-Choline", "CDP-choline", "CHEBI:58779", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_PC-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:36702", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
## dgo_to_peo
c("M_DG-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:52595", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_CDP-Ethanolamine", "CDP-ethanolamine", "CHEBI:57876", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_PE-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:60520", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
## pep_to_lpep
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_FA", "a carboxylate", "CHEBI:29067", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
## lpep_to_mgp
c("M_1-LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_1-MG-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycerol", "CHEBI:77297", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_Phosphoethanolamine", "phosphoethanolamine", "CHEBI:58190", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
## lpep_to_lpap
c("M_1-LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_LPA-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:77283", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
## pco_to_lpco
c("M_PC-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:36702", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
## lpao_to_pao
c("M_LPA-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58014", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
c("M_PA-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:73332", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
## pao_to_dgo
c("M_PA-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:73332", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
c("M_DG-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:52595", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
## sn1mg_to_dg
c("M_1-MG", "a 1-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:64683", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_1-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
## lpco_to_lpao
c("M_1-LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_1-LPA-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58014", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_Choline", "choline", "CHEBI:15354", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
## pi_to_dg
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_myo-Inositol-1-P", "1D-myo-inositol 1-phosphate", "CHEBI:58433", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
## pe_to_sn2lpe
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_2-LPE", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:65213", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
## pg_to_sn1lpg
c("M_PG", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_1-LPG", "1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64840", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
## pe_to_sn1lpe
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_1-LPE", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64381", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
## dhcer_to_dhsm
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
c("M_DhCer", "an N-acylsphinganine", "CHEBI:31488", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
c("M_DhSM", "an N-acylsphinganine-1-phosphocholine", "CHEBI:67090", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
## sn2lpc_to_fa
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_Glycerophosphocholine", "sn-glycerol 3-phosphocholine", "CHEBI:16870", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
## pc_to_ps
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
c("M_L-Serine", "L-serine", "CHEBI:33384", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
c("M_PS", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine", "CHEBI:57262", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
c("M_Choline", "choline", "CHEBI:15354", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
## pe_to_nape_sn1
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
## pe_to_nape_sn2
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
## dhsm_to_dhcer
c("M_DhSM", "an N-(acyl)-sphingosylphosphocholine", "CHEBI:64583", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_DhCer", "an N-acyl-sphingoid base", "CHEBI:83273", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
## lnape_to_gpnae
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_LNAPE", "N,1-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:85216", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_GPNAE", "N-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:85225", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
## nape_to_lnape
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_LNAPE", "N,1-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:85216", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
## sm_to_cer
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_SM", "N-(hexadecanoyl)-sphing-4-enine-1-phosphocholine", "CHEBI:78646", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_Cer", "N-hexadecanoylsphing-4-enine", "CHEBI:72959", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
## dhcer_to_cer
c("M_DhCer", "an N-acylsphinganine", "CHEBI:31488", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_Fe2+-cytochrome_b5", "Fe(II)-[cytochrome b5]", "CHEBI:29033", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_O2", "O2", "CHEBI:15379", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_Fe3+-cytochrome_b5", "Fe(III)-[cytochrome b5]", "CHEBI:57540", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
## coa_to_fao
c("M_AcylCoA", "a long-chain fatty acyl-CoA", "CHEBI:83139", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_NADPH", "NADPH", "CHEBI:57783", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_FAO", "a long-chain primary fatty alcohol", "CHEBI:77396", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_NADP", "NADP(+)", "CHEBI:58349", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
## sphinga_to_dhcer
c("M_AcylCoA", "a fatty acyl-CoA", "CHEBI:77636", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_Sphinganine", "a sphingoid base", "CHEBI:84410", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_DhCer", "an N-acyl-sphingoid base", "CHEBI:83273", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
## pep_to_napep_sn1
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_NAPEP", "N-acyl-1-[(1Z)-alkenyl]-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine","CHEBI:140451", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
## pe_to_dg
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_P-Ethanolamine", "phosphoethanolamine", "CHEBI:58190", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
## sn2lpe_to_fa
## Reaction in RHEA not exisiting so far
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_2-LPE", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:65213", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_Glycerophosphoethanolamine", "sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:143890", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
## lpeo_to_peo
## same as peo_to_lpeo??
## reaction not exiisting in Rhea
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
c("M_LPE-O", "", "", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
## sn2mg_to_sn1mg
## Reaction in RHEA not exisiting
c("M_2-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", NA, NA, NA, "sn2mg_to_sn1mg"),
c("M_1-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", NA, NA, NA, "sn2mg_to_sn1mg"),
## nape_to_pnae
## reaction not existing in Rhea so far
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
c("M_PNAE", "N-acylethanolamine phosphate", "CHEBI:145538", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
## napeo_to_nae
## reaction not existing in Rhea so far
c("M_NAPEO", "", "", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
c("M_NAE", "an N-acylethanolamine", "CHEBI:52640", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
c("M_PA-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:73332", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
## pe_to_pa
## reaction not present in Rhea so far
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
## peo_to_lpeo
## reaction not present in Rhea so far
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_LPE-O", "", "", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
## peo_to_napeo_sn1
## reaction not present in Rhea so far
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
c("M_NAPEO", "", "", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
## peo_to_napeo_sn2
## reaction not prsent in Rhea so far
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
c("M_NAPEO", "", "", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
## pep_to_napep_sn2
## reaction currently not existing in Rhea
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"),
c("M_NAPEP", "N-acyl-1-[(1Z)-alkenyl]-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:140451", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"))
## set colnames
colnames(res) <- c("name_LipidNetworkPredictR", "name_RHEA", "ChEBI_ID",
"RHEA_ID_undetermined", "RHEA_ID_left_to_right",
"RHEA_ID_right_to_left", "RHEA_ID_both_directions")
## return the object
res
}
michaelwitting/wormLipidPredictR documentation built on Jan. 30, 2025, 12:30 a.m.
R Package Documentation
Browse R Packages
We want your feedback!
Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Defines functions mappingTable
Documented in mappingTable
#' @name mappingTable
#'
#' @title Create a mapping table to map between LipidNetworkPredictR and RHEA metabolite names
#'
#' @description
#' The function returns a \code{data.frame} containing information of
#' corresponding features from \code{LipidNetworkPredictR}, the
#' \code{RHEA} database and \code{ChEBI} database.
#'
#' @details
#' The mapping table is derived from the file
#' `rhea-reactions.txt`.
#'
#' @return data.frame
#'
#' @author Thomas Naake, \email{thomasnaake@@googlemail.com}
#'
#' @examples
#' LipidNetworkPredictR:::mappingTable()
mappingTable <- function() {
## name_LipidNetworkPredictR, name_RHEA, ChEBI_ID, RHEA_ID_undetermined, RHEA_ID_left_to_right, RHEA_ID_right_to_left, RHEA_ID_both_directions
res <- rbind(
## dg_to_pa
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_ADP", "ADP", "CHEBI:456216", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:10272", "RHEA:10273", "RHEA:10274", "RHEA:10275"),
## pc_to_dg
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:10604", "RHEA:10605", "RHEA:10606", "RHEA:10607"),
## dg_to_tg
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
c("M_TG", "a triacyl-sn-glycerol", "CHEBI:64615", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:10868", "RHEA:10869", "RHEA:10870", "RHEA:10871"),
## cdpdg_to_pi
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_myo-Inositol", "myo-inositol", "CHEBI:17268", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:11580", "RHEA:11581", "RHEA:11582", "RHEA:11583"),
## cer_to_glccer
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_UDP-Glucose", "UDP-alpha-D-glucose", "CHEBI:58885", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_GlcCer", "a beta-D-glucosyl-(1<->1')-N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:22801", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
c("M_UDP", "UDP", "CHEBI:58223", "RHEA:12088", "RHEA:12089", "RHEA:12090", "RHEA:12091"),
## cdpdg_to_pgp
c("M_Glycerol-3-P", "sn-glycerol 3-phosphate", "CHEBI:57597", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_PGP", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycero-3'-phosphate)", "CHEBI:60110", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:12593", "RHEA:12594", "RHEA:12595", "RHEA:12596"),
## sn1lpc_to_pc
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:12937", "RHEA:12938", "RHEA:12939", "RHEA:12940"),
## pc_to_pa
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_Choline", "choline", "CHEBI:15354", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:14445", "RHEA:14446", "RHEA:14447", "RHEA:14448"),
## sn1lpc_to_fa
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
c("M_Glycerophosphocholine", "sn-glycerol 3-phosphocholine", "CHEBI:16870", "RHEA:15177", "RHEA:15178", "RHEA:15179", "RHEA:15180"),
## coa_to_lpa
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
c("M_Glycerol-3-P", "sn-glycerol 3-phosphate", "CHEBI:57597", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
c("M_LPA", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:57970", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:15325", "RHEA:15326", "RHEA:15327", "RHEA:15328"),
## fa_to_coa
c("M_FA", "a long-chain fatty acid", "CHEBI:57560", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_AcylCoA", "a long-chain fatty acyl-CoA", "CHEBI:83139", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_AMP", "AMP", "CHEBI:456215", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_PPi", "diphosphate", "CHEBI:33019", "RHEA:15421", "RHEA:15422", "RHEA:15423", "RHEA:15424"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_AcylCoA", "a fatty acyl-CoA", "CHEBI:77636", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_AMP", "AMP", "CHEBI:456215", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
c("M_PPi", "diphosphate", "CHEBI:33019", "RHEA:38883", "RHEA:38884", "RHEA:38885", "RHEA:38886"),
## pc_to_sn1lpc
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:15801", "RHEA:15802", "RHEA:15803", "RHEA:15804"),
## pa_to_cdpdg
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_CTP", "CTP", "CHEBI:37563", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
c("M_PPi", "diphosphate", "CHEBI:33019", "RHEA:16229", "RHEA:16230", "RHEA:16231", "RHEA:16232"),
## lpep_to_pep
c("M_LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:16245", "RHEA:16246", "RHEA:16247", "RHEA:16248"),
## lpep_to_fal
c("M_1-LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
c("M_FAL", "a 2,3-saturated aldehyde", "CHEBI:73359", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
c("M_Glycerophosphoethanolamine", "sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:143890", "RHEA:16905", "RHEA:16906", "RHEA:16907", "RHEA:16908"),
## nae_to_fa
## Both are correct, but the second reaction is the more generic one
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_NAE", "N-(long-chain fatty acyl)ethanolamine", "CHEBI:15897", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_FA", "a long-chain fatty acid", "CHEBI:57560", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:17505" , "RHEA:17506", "RHEA:17507", "RHEA:17508"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
c("M_NAE", "an N-acylethanolamine", "CHEBI:52640", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:39995" , "RHEA:39996", "RHEA:39997", "RHEA:39998"),
## coa_to_acdhap
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
c("M_Dihydroxyacetone-P", "dihydroxyacetone phosphate", "CHEBI:57642", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
c("M_AcylDHAP", "a 1-acylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:57534", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:17657", "RHEA:17658", "RHEA:17659", "RHEA:17660"),
## coa_to_ce
c("M_Cholesterol", "cholesterol", "CHEBI:16113", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
c("M_CE", "a cholesterol ester", "CHEBI:17002", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:17729", "RHEA:17730", "RHEA:17731", "RHEA:17732"),
## cer_to_cerp
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_ADP", "ADP", "CHEBI:456216", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_CerP", "an N-acylsphing-4-enine 1-phosphate", "CHEBI:57674", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:17929", "RHEA:17930", "RHEA:17931", "RHEA:17932"),
## pi_to_sn1lpi
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_1-LPI", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:64771", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:18001", "RHEA:18002", "RHEA:18003", "RHEA:18004"),
## pc_to_sn2lpc
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:18689", "RHEA:18690", "RHEA:18691", "RHEA:18692"),
## cer_to_sm
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
c("M_SM", "a sphingomyelin", "CHEBI:17636", "RHEA:18765", "RHEA:18766", "RHEA:18767", "RHEA:18768"),
## lpa_to_pa
c("M_LPA", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:57970", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:19709", "RHEA:19710", "RHEA:19711", "RHEA:19712"),
## ps_to_pe
c("M_PS", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine", "CHEBI:57262", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
c("M_CO2", "CO2", "CHEBI:16526", "RHEA:20828", "RHEA:20829", "RHEA:20830", "RHEA:20831"),
## peo_to_pep
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_Fe2+-cytochrome_b5", "Fe(II)-[cytochrome b5]", "CHEBI:29033", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_O2", "O2", "CHEBI:15379", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_Fe3+-cytochrome_b5", "Fe(III)-[cytochrome b5]", "CHEBI:29034", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:22956", "RHEA:22957", "RHEA:22958", "RHEA:22959"),
## lpco_to_pco
c("M_1-LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
c("M_PC-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:36702", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:23992", "RHEA:23993", "RHEA:23994", "RHEA:23995"),
## pa_to_dg
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:27429", "RHEA:27430", "RHEA:27431", "RHEA:27432"),
## pe_to_ps
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
c("M_L-Serine", "L-serine", "CHEBI:33384", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
c("M_PS", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine", "CHEBI:57262", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:27606", "RHEA:27607", "RHEA:27608", "RHEA:27609"),
## sn2mg_to_fa
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_FA", "a carboxylate", "CHEBI:29067", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_Glycerol", "glycerol", "CHEBI:17754", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32871", "RHEA:32872", "RHEA:32873", "RHEA:32874"),
## pg_to_cl
c("M_PG", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_CDP-DG", "a CDP-1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:58332", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_CL", "a cardiolipin", "CHEBI:62237", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32931", "RHEA:32932", "RHEA:32933", "RHEA:32934"),
## cl_to_lcl
c("M_CL", "a cardiolipin", "CHEBI:62237", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_1,2,4-LCL", "1'-[1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho],3'-[1-acyl-sn-glycero-3-phospho]-glycerol", "CHEBI:64743", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32935", "RHEA:32936", "RHEA:32937", "RHEA:32938"),
## dg_to_pc
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_CDP-Choline", "CDP-choline", "CHEBI:58779", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32939", "RHEA:32940", "RHEA:32941", "RHEA:32942"),
## dg_to_pe
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_CDP-Ethanolamine", "CDP-ethanolamine", "CHEBI:57876", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32943", "RHEA:32944", "RHEA:32945", "RHEA:32946"),
## sn2mg_to_dg
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:32947", "RHEA:32948", "RHEA:32949", "RHEA:32950"),
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:16741", "RHEA:16742", "RHEA:16743", "RHEA:16744"),
## sn1lpe_to_fa
c("M_1-LPE", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64381", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
c("M_Glycerophosphoethanolamine", "sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:143890", "RHEA:32967", "RHEA:32968", "RHEA:32969", "RHEA:32970"),
## sn1lpe_to_pe
c("M_1-LPE", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64381", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:32995", "RHEA:32996", "RHEA:32997", "RHEA:32998"),
## nape_to_nae
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_NAE", "an N-acylethanolamine", "CHEBI:52640", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33159", "RHEA:33160", "RHEA:33161", "RHEA:33162"),
## sn1lpi_to_pi
c("M_1-LPI", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:64771", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:33195", "RHEA:33196", "RHEA:33197", "RHEA:33198"),
## sn1lpg_to_pg
c("M_1-LPG", "1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64840", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
c("M_PG", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:33203", "RHEA:33204", "RHEA:33205", "RHEA:33206"),
## tg_to_dg
c("M_TG", "a triacyl-sn-glycerol", "CHEBI:64615", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33271", "RHEA:33272", "RHEA:33273", "RHEA:33274"),
c("M_TG", "a triacyl-sn-glycerol", "CHEBI:64615", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44864", "RHEA:44865", "RHEA:44866", "RHEA:44867"),
## dg_to_sn2mg
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_2-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33275", "RHEA:33276", "RHEA:33277", "RHEA:33278"),
## cerp_to_cer
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
c("M_CerP", "an N-acylsphing-4-enine 1-phosphate", "CHEBI:57674", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:33743", "RHEA:33744", "RHEA:33745", "RHEA:33746"),
## sn1mg_to_lpa
c("M_1-MG", "a 1-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:64683", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_ATP", "ATP", "CHEBI:30616", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_LPA", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:57970", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_ADP", "ADP", "CHEBI:456216", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:33747", "RHEA:33748", "RHEA:33749", "RHEA:33750"),
## pgp_to_pg
c("M_PGP", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycero-3'-phosphate)", "CHEBI:60110", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
c("M_PG", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:33751", "RHEA:33752", "RHEA:33753", "RHEA:33754"),
## sn1mg_to_fa
c("M_1-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_Glycerol", "glycerol", "CHEBI:17754", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:34019", "RHEA:34020", "RHEA:34021", "RHEA:34022"),
## dg_to_sn1mg
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_1-MG", "a 1-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:64683", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:35663", "RHEA:35664", "RHEA:35665", "RHEA:35666"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_1-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44712", "RHEA:44713", "RHEA:44714", "RHEA:44715"),
## lcl_to_cl
c("M_1,2,4-LCL", "1'-[1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho],3'-[1-acyl-sn-glycero-3-phospho]-glycerol", "CHEBI:64743", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
c("M_CL", "a cardiolipin", "CHEBI:62237", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:35839", "RHEA:35840", "RHEA:35841", "RHEA:35842"),
## lpco_to_mgo
c("M_1-LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_1-MG-O", "1-O-alkyl-sn-glycerol", "CHEBI:15850", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:36083", "RHEA:36084", "RHEA:36085", "RHEA:36086"),
## acyldhap_to_alkyldhap
c("M_AcylDHAP", "a 1-acylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:57534", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_FAO", "a long chain fatty alcohol", "CHEBI:17135", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_FA", "a long-chain fatty acid", "CHEBI:57560", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
c("M_AlkylDHAP", "1-O-alkylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:73315", "RHEA:36171", "RHEA:36172", "RHEA:36173", "RHEA:36174"),
## alkyldhap_to_lpao
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_NADPH", "NADPH", "CHEBI:57783", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_AlkylDHAP", "1-O-alkylglycerone 3-phosphate", "CHEBI:73315", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_LPA-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58014", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
c("M_NADP", "NADP(+)", "CHEBI:58349", "RHEA:36175", "RHEA:36176", "RHEA:36177", "RHEA:36178"),
## dgo_to_pco
c("M_DG-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:52595", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_CDP-Choline", "CDP-choline", "CHEBI:58779", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_PC-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:36702", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36179", "RHEA:36180", "RHEA:36181", "RHEA:36182"),
## dgo_to_peo
c("M_DG-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:52595", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_CDP-Ethanolamine", "CDP-ethanolamine", "CHEBI:57876", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_PE-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:60520", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_CMP", "CMP", "CHEBI:60377", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36187", "RHEA:36188", "RHEA:36189", "RHEA:36190"),
## pep_to_lpep
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_FA", "a carboxylate", "CHEBI:29067", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36195", "RHEA:36196", "RHEA:36197", "RHEA:36198"),
## lpep_to_mgp
c("M_1-LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_1-MG-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycerol", "CHEBI:77297", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
c("M_Phosphoethanolamine", "phosphoethanolamine", "CHEBI:58190", "RHEA:36199", "RHEA:36200", "RHEA:36201", "RHEA:36202"),
## lpep_to_lpap
c("M_1-LPE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77288", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_LPA-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:77283", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36203", "RHEA:36204", "RHEA:36205", "RHEA:36206"),
## pco_to_lpco
c("M_PC-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:36702", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:36231", "RHEA:36232", "RHEA:36233", "RHEA:36234"),
## lpao_to_pao
c("M_LPA-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58014", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
c("M_PA-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:73332", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:36235", "RHEA:36236", "RHEA:36237", "RHEA:36238"),
## pao_to_dgo
c("M_PA-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:73332", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
c("M_DG-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:52595", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
c("M_Pi", "phosphate", "CHEBI:43474", "RHEA:36239", "RHEA:36240", "RHEA:36241", "RHEA:36242"),
## sn1mg_to_dg
c("M_1-MG", "a 1-acyl-sn-glycerol", "CHEBI:64683", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:38463", "RHEA:38464", "RHEA:38465", "RHEA:38466"),
c("M_1-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacylglycerol", "CHEBI:49172", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:39943", "RHEA:39944", "RHEA:39945", "RHEA:39946"),
## lpco_to_lpao
c("M_1-LPC-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:30909", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_1-LPA-O", "1-O-alkyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58014", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_Choline", "choline", "CHEBI:15354", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:39927", "RHEA:39928", "RHEA:39929", "RHEA:39930"),
## pi_to_dg
c("M_PI", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1D-myo-inositol)", "CHEBI:57880", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_myo-Inositol-1-P", "1D-myo-inositol 1-phosphate", "CHEBI:58433", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:43484", "RHEA:43485", "RHEA:43486", "RHEA:43487"),
## pe_to_sn2lpe
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_2-LPE", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:65213", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44408", "RHEA:44409", "RHEA:44410", "RHEA:44411"),
## pg_to_sn1lpg
c("M_PG", "1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64716", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_1-LPG", "1-acyl-sn-glycero-3-phospho-(1'-sn-glycerol)", "CHEBI:64840", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44416", "RHEA:44417", "RHEA:44418", "RHEA:44419"),
## pe_to_sn1lpe
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_1-LPE", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64381", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44604", "RHEA:44605", "RHEA:44606", "RHEA:44607"),
## dhcer_to_dhsm
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
c("M_DhCer", "an N-acylsphinganine", "CHEBI:31488", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
c("M_DhSM", "an N-acylsphinganine-1-phosphocholine", "CHEBI:67090", "RHEA:44620", "RHEA:44621", "RHEA:44622", "RHEA:44623"),
## sn2lpc_to_fa
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
c("M_Glycerophosphocholine", "sn-glycerol 3-phosphocholine", "CHEBI:16870", "RHEA:44696", "RHEA:44697", "RHEA:44698", "RHEA:44699"),
## pc_to_ps
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
c("M_L-Serine", "L-serine", "CHEBI:33384", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
c("M_PS", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine", "CHEBI:57262", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
c("M_Choline", "choline", "CHEBI:15354", "RHEA:45088", "RHEA:45089", "RHEA:45090", "RHEA:45091"),
## pe_to_nape_sn1
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:45188", "RHEA:45189", "RHEA:45190", "RHEA:45191"),
## pe_to_nape_sn2
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:45192", "RHEA:45193", "RHEA:45194", "RHEA:45195"),
## dhsm_to_dhcer
c("M_DhSM", "an N-(acyl)-sphingosylphosphocholine", "CHEBI:64583", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_DhCer", "an N-acyl-sphingoid base", "CHEBI:83273", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:45300", "RHEA:45301", "RHEA:45302", "RHEA:45303"),
## lnape_to_gpnae
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_LNAPE", "N,1-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:85216", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
c("M_GPNAE", "N-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:85225", "RHEA:45420", "RHEA:45421", "RHEA:45422", "RHEA:45423"),
## nape_to_lnape
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_LNAPE", "N,1-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:85216", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45460", "RHEA:45461", "RHEA:45462", "RHEA:45463"),
## sm_to_cer
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_SM", "N-(hexadecanoyl)-sphing-4-enine-1-phosphocholine", "CHEBI:78646", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_Cer", "N-hexadecanoylsphing-4-enine", "CHEBI:72959", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
c("M_Phosphocholine", "phosphocholine", "CHEBI:295975", "RHEA:45644", "RHEA:45645", "RHEA:45646", "RHEA:45647"),
## dhcer_to_cer
c("M_DhCer", "an N-acylsphinganine", "CHEBI:31488", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_Fe2+-cytochrome_b5", "Fe(II)-[cytochrome b5]", "CHEBI:29033", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_O2", "O2", "CHEBI:15379", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_Cer", "an N-acylsphing-4-enine", "CHEBI:52639", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_Fe3+-cytochrome_b5", "Fe(III)-[cytochrome b5]", "CHEBI:57540", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:46544", "RHEA:46545", "RHEA:46546", "RHEA:46547"),
## coa_to_fao
c("M_AcylCoA", "a long-chain fatty acyl-CoA", "CHEBI:83139", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_NADPH", "NADPH", "CHEBI:57783", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_FAO", "a long-chain primary fatty alcohol", "CHEBI:77396", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
c("M_NADP", "NADP(+)", "CHEBI:58349", "RHEA:52716", "RHEA:52717", "RHEA:52718", "RHEA:52719"),
## sphinga_to_dhcer
c("M_AcylCoA", "a fatty acyl-CoA", "CHEBI:77636", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_Sphinganine", "a sphingoid base", "CHEBI:84410", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_DhCer", "an N-acyl-sphingoid base", "CHEBI:83273", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:53424", "RHEA:53425", "RHEA:53426", "RHEA:53427"),
## pep_to_napep_sn1
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57875", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
c("M_NAPEP", "N-acyl-1-[(1Z)-alkenyl]-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine","CHEBI:140451", "RHEA:63596", "RHEA:63597", "RHEA:63598", "RHEA:63599"),
## pe_to_dg
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_P-Ethanolamine", "phosphoethanolamine", "CHEBI:58190", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", "RHEA:78951", "RHEA:78952", "RHEA:78953", "RHEA:78954"),
## sn2lpe_to_fa
## Reaction in RHEA not exisiting so far
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_2-LPE", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:65213", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
c("M_Glycerophosphoethanolamine", "sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:143890", NA, NA, NA, "sn2lpe_to_fa"),
## lpeo_to_peo
## same as peo_to_lpeo??
## reaction not exiisting in Rhea
c("M_AcylCoA", "an acyl-CoA", "CHEBI:58342", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
c("M_LPE-O", "", "", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
c("M_CoA", "CoA", "CHEBI:57287", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "lpeo_to_peo"),
## sn2mg_to_sn1mg
## Reaction in RHEA not exisiting
c("M_2-MG", "a 1-acylglycerol", "CHEBI:35759", NA, NA, NA, "sn2mg_to_sn1mg"),
c("M_1-MG", "a 2-acylglycerol", "CHEBI:17389", NA, NA, NA, "sn2mg_to_sn1mg"),
## nape_to_pnae
## reaction not existing in Rhea so far
c("M_NAPE", "N-acyl-1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:62537", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
c("M_PNAE", "N-acylethanolamine phosphate", "CHEBI:145538", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
c("M_1,2-DG", "a 1,2-diacyl-sn-glycerol", "CHEBI:17815", NA, NA, NA, "nape_to_pnae"),
## napeo_to_nae
## reaction not existing in Rhea so far
c("M_NAPEO", "", "", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
c("M_NAE", "an N-acylethanolamine", "CHEBI:52640", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
c("M_PA-O", "1-O-alkyl-2-acyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:73332", NA, NA, NA, "napeo_to_nae"),
## pe_to_pa
## reaction not present in Rhea so far
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_PE", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:64612", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_Ethanolamine", "ethanolamine", "CHEBI:57603", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
c("M_PA", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate", "CHEBI:58608", NA, NA, NA, "pe_to_pa"),
## peo_to_lpeo
## reaction not present in Rhea so far
c("M_H2O", "H2O", "CHEBI:15377", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_H+", "H(+)", "CHEBI:15378", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_LPE-O", "", "", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
c("M_FA", "a fatty acid", "CHEBI:28868", NA, NA, NA, "peo_to_lpeo"),
## peo_to_napeo_sn1
## reaction not present in Rhea so far
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
c("M_NAPEO", "", "", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
c("M_2-LPC", "a 2-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn1"),
## peo_to_napeo_sn2
## reaction not prsent in Rhea so far
c("M_PE-O", "1-(1,2-saturated alkyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:75028", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
c("M_NAPEO", "", "", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", NA, NA, NA, "peo_to_napeo_sn2"),
## pep_to_napep_sn2
## reaction currently not existing in Rhea
c("M_PE-P", "1-O-(1Z-alkenyl)-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:77290", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"),
c("M_PC", "a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:57643", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"),
c("M_NAPEP", "N-acyl-1-[(1Z)-alkenyl]-2-acyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine", "CHEBI:140451", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"),
c("M_1-LPC", "a 1-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine", "CHEBI:58168", NA, NA, NA, "pep_to_napep_sn2"))
## set colnames
colnames(res) <- c("name_LipidNetworkPredictR", "name_RHEA", "ChEBI_ID",
"RHEA_ID_undetermined", "RHEA_ID_left_to_right",
"RHEA_ID_right_to_left", "RHEA_ID_both_directions")
## return the object
res
}
R Package Documentation
Browse R Packages
We want your feedback!
Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Embedding an R snippet on your website
Add the following code to your website.
For more information on customizing the embed code, read Embedding Snippets.